При перелете в Корею через Пекин код здоровья обязательно нужно будет заполнять ?

Да обязательно.

Там стоит китайский сотрудник аэропорта помогает заполнить.

Вроде это только тем кто остается в Китае, а для транизита нет.

Обязательно. Он может быть заполнен через сайт, до прибытия в Китай ( но нужно уже знать ваши посадочные). Либо в самом аэропорту есть аппараты, которые помогают его получить. Летели через Пек, там сотрудник аэропорта нам помог заполнить за пару кликов. Проблем не возникло.