Подскажите: при наличии греческого Шенгена, Албания пропустит транзитом в Черногорию если ехать на авто? Или надо все же подавать на визу?

Пропустит. По Шенгену вы можете находиться в Албании 90 из 180 дней.(Я про мульти шенген). При краткосрочном тоже можно, до даты окончания Шенгена. Единственное что, покажите на границе бронь отеля в Черногории, чтобы погранцы не усомнились, что вы покинете Албанию до истечения срока шенгена(это если он выдан на короткий срок)