Какую валюту лучше обменивать в Таджикистане - рубли или доллары?

Лучше доллары.

Если речь идет о покупке валюты в РФ и затем обмене в Таджикистане на сомони - то проще поменять рубли. С долларом а) надо еще умудриться купить его в РФ по нормальному курсу, б) больше потеряете, потому что заплатите за двойную конвертацию валют. Рубли принимают во многих банках, поменяют на сомони по курсу. Также можно снять с карты МИР просто в банкомате.