У кого есть опыт репатриации в Израиль, подскажите, чем грозит пересечение российской границы с Израильским паспортом без русского?

Административной ответственностью.

Если у вас гражданство РФ, то в основном тем, что вас не выпустят обратно из РФ без действующего заграна РФ.

В сторону России - штрафом, из России - невыпуском. Или же ничем. У меня знакомый недавно съездил в Россию и успешно вернулся по даркону. Но тут везение важно, конечно.