У кого есть опыт репатриации в Израиль, скажите, на ИНН апостиль нужно ставить? Если прилетаем после 1 сентября?

Нет.

Инн может понадобиться только в банке, но у многих не спрашивают вообще, на кп и в мвд не нужен, апостиль в банке вряд ли спросят.