Подскажите пожалуйста, по какому маршруту лучше ехать со стороны Венгрии через Сербию, слышала, что через Косово плохая дорога и есть маршрут получше?

Можно через Черногорию, можно через Македонию. Примерно одинаково. Но зависит от вашего паспорта и наличия виз. Через Македонию не всех пускают.

Если ваши документы позволяют заезд в Косово, то это наилучший маршрут Белград-Ниш- почти Скопье автострада. Там в Косово и выезд на автостраду Приштин-Тирана. 30км примерно, но нормальная дорога частями 2, частями 4 полосная, через городки, не разгонишься.