2 года назад въехала в Азербайджан по заграну Азербайджана. Теперь хочу получить загранпаспорт России в Баку и по нему пересечь границу в Россию. Могут ли возникнуть какие-нибудь проблемы на границе?

Могут спросить пограничники Азербайджана, как вы, гражданка России, попали в Азербайджан. Будьте готовы ответить на этот вопрос. Лучше как есть. Разумнее было бы вылетать по азербайджанскому паспорту, а по прибытии в Россию предъявить российский паспорт.