Нужно сделать генеральную доверенность на отца чтоб забрал мой паспорт в Молдавии из паспортного, могу ли её сделать в посольстве, и примут ли её в Молдавии?

Примут, может подойти и доверенность от обычного нотариуса, не обязательно из консульства. У нас только что была аналогичная ситуация, человек забрал загран мужа из посольства Молдовы в Минске. Доверку делали в Москве у обычного нотариуса.