Если заканчивается виза на Филиппинах, то надо идти в эмиграционное здание? Нужно ли что-то заполнять в интернете, чтобы прийти, или можно сразу приходить с деньгами и сразу выдадут визу?

Да, идете в иммиграционное бюро, с собой деньги наличкой и паспорт (если есть, то бумаги от предыдущих продлений), заранее ничего не нужно заполнять, на месте дадут анкету, заполните, оплатите, получите продление.