Подскажите, если у меня номинация, и с ней я засабмитил документы в Express Entry, но пришел отказ из-за отсутствия документов, то моя номинация сгорает?

Вам надо сдедать новый Экспресс Энтри профиль и данными нового профиля отослать документы в SINP (можно по мейлу) и попросить их выдать вам новую номинацию. Вы можете сразу приложить письмо с отказом, почему вам отказали в заявлении.