Стоит ли подписать рабочий договор электронно в Австрии или лучше на бумаге для всяких продлений в будущем?

Нормально, можно так делать Для всяких продлений требуют Lohnzettel'и.

3 раза уже в Австрии подписывал только электронно, so far so good.

Тебе рабочий договор нужен примерно «никуда». Зарплатные квитки принеси на продление и молодец!

Я бы на бумаге подписала, но только по причине того, чтобы самой не распечатывать. Потом убрать в папочку: «посмотрю туда когда-нибудь никогда или когда захочу повышение зарплаты попросить».