Я гражданка Молдовы, есть и гражданство РФ. Уже как 2 года живу в Молдове. В прошлом году вышла замуж, поменяла фамилию.

Нет конечно. В РФ вы должны влететь с паспортом РФ, когда вы поменяли фамилию, автоматически все доки со старой фамилией стали недействительны. Сама прошла через это. Но, т. к. вы в другой стране находились, могут ничего не сказать, но по приезду нужно будет заменить все документы.