В чем смысл делать сперва нотариальную копию диплома с апостилеи, а потом уже нотариальный перевод?

На копию.

Два апостиля требует Венский экономический кажется. Сначала обычный, а потом на нотариальный перевод, как бы заверить действительность нотариуса. Это МВД апостиль уже.

Перевод должен прикрепляться к оригиналу документа. Вы можете прикрепить его к оригиналу диплома. Но проще сделать копию диплома, перевести её и прикрепить перевод к копии. Иначе потом, если Вам потребуется перевод на другой язык, переводчику придётся переводить диплом и первый перевод и так до бесконечности.