Прошу совета по ситуации. Гражданка РФ. Виза Франции ( С). Границу Франции ранее не пересекла с ней, но страны ЕС да.

Риск есть всегда, могут придраться, а могут нет, как повезёт. Но в следующий раз Франция вам просто не даст визу.

Немцы могут домотаться. Если вы сейчас в РФ, въезжайте через Францию, далее в Берлин. И будет вам счастье.