Если уезжаешь после записи на КП до самой КП, нужны ли какие-то отметки в паспорте?

Вам могут дать бумагу о записи, но могут и не дать. Никаких печатей в паспорт, кро депортации, Израиль не ставит (даже о ней вроде только бумага с печатью). Лучше этим не развлекаться особо. Сохраняйте туристическую визу первую, всех предупреждайте и прочее. Если вы нееврей, то общем не советую таким заниматься в одиночку.