В ноябре подали документы в Москве. Анкеты были в виде сканов. С января анкеты принимают только в электронном виде. Что делать: ждать или подавать ещё раз в электронном виде? Но тогда у справки о несудимости истечет срок. Как поступить?

Справка о несудимости должна быть годной как к КП, так и к подаче в МВД Израиля.

Справку надо заказывать, когда Вам уже дату встречи назначили. Раньше нет смысла.

В любом случае, с вам свяжутся и предложат заполнить онлайн анкету. Поэтому имеет смысл заполнить и отправить сейчас, как можно быстрее. После отправки будет назначен номер анкеты. После этого, рекомендую написать на почту и пояснить ситуацию, что в ноябре отправляли бумажную, и сейчас отправили электронную, с таким то номером. Скорее всего, это ускорит рассмотрение. Ибо тех людей которые ранее отправляли бумажные рассматривают вне очереди.