Я въехала по визе невесты, виза три месяца, а я вышла замуж только через 2 с копейками.

Да, вам нужно было податься на ВНЖ через 30 дней с въезда. Если у вас осталось время, нужно выехать на сутки и вернуться и сразу подать на ВНЖ. В любом случае у вас первое ВНЖ будет ВНЖ невесты, потому оно даётся строго под основания визы Д.