Можно ли улететь в Германию по визе другой шенген страны, неоткрытой? Проблемы есть на таможке или можно сразу в берлин?

Мнения расходятся. Готовым надо быть к тому, что сейчас на это смотрят плохо. Возможно, что в будущем у вас будут проблемы с получением визы. Или вы докажете, что Германия страна транзита. Кстати, таможня здесь не при чем. За паспортно визовый режим отвечают пограничники.