Выезжаю из Молдавии на автобусе в Россию. В Молдавию заезжала по российскому паспорту самолет, выезжать из Молдавии на автобусе тоже по российскому?

В российском паспорте поставили печать въезда в Молдавию? Значит, нужно поставить печать выезда. А дальше у румын молдавский загранпаспорт с биометрией. Российский достанете из кармана только на российском погранпереходе.

Если Вы въезжали в Молдову по российскому паспорту (скорее всего в этот момент у Вас не было молдавского, иначе почему бы по молдавскому не въехать), после этого получили в Молдове молдавский загранпаспорт, то выезжать из Молдовы Вы можете по молдавскому загранпаспорту (Вам же придется его показывать молдавским пограничникам при выезде из Молдовы на границе с Румынией, по российскому Вас не выпустят). Российский нужен будет только при въезде в РФ. Уведомление о втором гражданстве никак не связано с поездкой. Уведомите, когда приедете в РФ.