Если по транзитной, визе, которая на 5 дней, из Гонконга в Шенжень на пару дней а потом обратно в Гонконг, пустят?

Нельзя использовать понятие транзит, если вы возвращаетесь туда же, откуда приехали. Транзит - это когда вы приехали из одной страны, а уехали в другую. Например, Москва - Пекин - Гонконг. В выбранном вами маршруте нужна полноценная виза, транзит не применим.