Подскажите пожалуйста, людям из Крыма при заполнении анкеты CUAET, нужно указывать о наличии российского гражданства?

Если у вас есть российский паспорт и вы планируете миграцию в Канаду с последующей легализацией в стране, то да, надо указывать. Вообще не врите в заявке, а то сейчас ничего, а потом может быть чревато.

Основному требованию программы вы соответствуете - у вас есть гражданство Украины, остальные гражданства не являются помехой для участия в программе, проверено лично.

Все, что вы укажите в заявке будет потом сто раз проверяться. Лучше не врать. Но дело хозяйское.