Подскажите, пожалуйста, а после 30.06 нельзя Шенген в паспорт российский поставить?

Дата 30.06 никак не привязана к шенгену в рф заграннике. это дата, до которой гражданам израиля (при наличии у них иных гражданств) можно вылетать из страны НЕ по даркону/тм, а по иным загранпаспортам.

Никакой связи.