по прилету в Мюнхен можно в аэропорту сразу сдать тест. Потом его загрузить. При негативе что делать дальше? Сколько сидеть на карантине, нужно ли снова на 5 й день тест сдавать?

Если были у родственников первой линии, то отправляете негативный тест в Gesundheitsamt, пишите, что были у родственников. По идее должны получить освобождение от карантина. Если же не получите, то да, на 5й день снова тест, чтобы сократить карантин, или без теста досиживаете до 10ти дней.