Скажите, с Российским паспортом могут не пустить через паспортный контроль аэропорта Кишинева?

Если есть у вас основания - по идее пустят. А просто так - нет.

Сижу в аэропорту, таких очень много. Не езжай, если не имеешь человека, который тебя встретит. А если такой есть, то и с ним гарантий не будет.