В заявке на k-eta указали “purpose of visit” - другое и вписали “транзит”, хотя по факту у нас самостоятельная стыковка будет. Стоит ли исправить или это особо не влияет на результат?

Да все равно все норм. Они никого не обманывают же, а просто перемудрили. И есть теория, что анкеты где вручную вписана цель путешествия всегда человек проверяет. Так как их роботу не доверяют)