Скажите, можно ли в Германию прилететь с пятилетней визой, выданной ещё до пандемии.

Можно, если у вас есть прививка, одобренная в Европе или по особым случаям.

Или через другие страны, открытые для россиян - Греция, Венгрия.

Пусть родители отправляются в Германию через одну из открытых стран - Венгрию, Эстонию, Грецию (отдельными независимыми билетами в эту страну и из этой страны в Германию), тогда можно без европрививки.