Есть ли у выпускников немецких университетов ( магистров) какие-то преференции перед теми, кто не имеет немецкого образования вообще?

По-моему опыту ценится исключительно релевантный опыт.

Формальные преференции для выпускников немецких вузов есть в местах, где требуется знания языка. Немецкий диплом считается одновременно подтверждением знания языка. В остальных случаях признанный иностранный диплом на сколько мне известно формально равноценен немецкому.

Есть два варианта виз - блукард. Там важна граница зарплаты. И обычная рабочая виза. Там на сколько я знаю важно показать отсутствие конкуренции с местными. Одним из критериев "отсутствия конкуренции" является зарплата "выше среднего". Но все эти рассуждения на сколько я знаю безотносителы к стране получения высшего образования.

Раньше даже выпускникам немецких вузов нужно было доказать Agentur für Arbeit , что на это место нет местного или европейца. Теперь это отменили пару лет назад.

Если работа по полученной в Германии специальности, доход должен быть выше актуального прожиточного минимума. И работодатель должен ряд бумаг заполнить, но там ничего критичного.