Подскажите, пожалуйста, можно ли с территории РФ проехать в Литву?

Конечно. Там же есть прямая граница.

Можно и через РБ и через РФ в Латвию , от туда в Литву. А можно из Калиниграда)

Если у вас росс загран и есть основание для выезда из РФ, тогда можно ехать напрямую, но если нет оснований для выезда, вас просто не выпустят, шенген виза и обычный туризм не является основанием для выезда. Тогда можно выехать через Беларусь, по такому маршруту, основания не нужны. Если вы не являетесь гражданином России тогда вам можно ехать напрямую.