Подскажите, пожалуйста, если я собираюсь находится в Германии больше года - в заявлении на визу не отмечать ничего, там где про это спрашивают?

Если это про галочку о намерении пребывать не более года, то, как я понимаю, отмечать не нужно) в крайнем случае на месте можно будет галочку добавить, если возникнет вопрос)