можно ли из Таиланда поехать самостоятельно в Комбоджию для продления ?

В основном сейчас через Малайзию делают.

А что продлевать хотите ? Километраж путешествия ? У вас существительного не хватает в вопросе. Если туристическую визу продлить, то это в тае в иммиграционном офисе делать надо. Если штамп безвизового прибывания, то он не продлятся. Надо выехать из тая и заехать снова, чтоб Новый штамп получить.