У жены временный ВНЖ на 5 лет на основании ЛЛП, получен год назад, мне, как мужу, нужно ждать 2 года с момента выдачи жене ВНЖ чтобы получить себе внж или можно получить ВНЖ или визу Д уже ?

Лучше напишите в Департамент миграции Литвы и опишите свою ситуацию. Возможно, что как супруги ЛЛП и не требуется ждать 2 года. Вообще, конечно, вам надо было вместе подавать на ВНЖ и вместе бы его получили.