Если ехать на автобусе из Кишинёва в Москву, на границе Латвии или Польши при предъявлении паспорта Молдовы с печатью о постоянном проживании в России могут спросить про паспорт РФ? И если спрашивают, предъявлять ли его?

Скорее всего не спросят. Много раз вылетая/ввезжая из РФ на границе РФ показывал паспорт Рф, европейским погранцам показывал паспорт Молдовы. Никогда вопросов не возникало. А, когда в конце сентября выезжал в Финляндию на границе РФ спросили, какой у меня второй документ, т. к. не нашли визы в паспорте рф. Показал паспорт Молдовы. Его, вероятно, внесли в базу и вернули мне оба паспорта.

В Литву из Минска заехала с такой же печатью в паспорте РМ, с опасением о расспросах) ни одного вопроса не было.