Скажите пожалуйста ставят ли штамп в загран паспорте если едешь на пароме с северного Кипра до Турции?

В Турции поставят.

Да ставят. Мне в кипрский не поставили, мужу в Греческий шлепнули. Поэтому в Ваш точно поставят.

В любом случае у вас там уже будет стоять турецкий штамп, что наводит на некоторые выводы.