Как сейчас можно доехать до Санкт-Петербурга из Германии кроме как через Хельсинки? И есть ли прямые полёты на Москву сейчас?

Прямых полетов из Германии в Москву просто нет сейчас, все с пересадками.

Ну тогда до Калининграда на маршрутке а потом на самолете в Питер самый оптимальный и экономичный вариант.

Можно еще до Таллина, дальше автобус.