Подскажите, пожалуйста, если у мужа молдавский и российский паспорт, впустят ли его по российскому в Молдавию?

Пустят конечно.

Он гражданин Молдовы, пустят.

Да пусть показывает сразу молдавский паспорт. Он же в Молдову летит ) Вопросов вообще не будет ) Или вам нужна обязательно отметка в рф паспорте ?