Подскажите пожалуйста, если из Вены на машине поехать в Хорватию, поставят ли хорваты штамп о въезде?

Поставят. Выездной из шенгена в словении не ставили, т. к. там где мы ехали граница была только хорватская.

Вчера выезжала в Черногорию из Дубровника на автобусе , ставили штампы с двух сторон что на въезде, что на выезде.

Ехал пару дней назад из Австрии в Черногорию, штампы ставили и в Словении на выезде и в хорватии на въезде. И в хорватии на выезде потом.