У кого-то был опыт прохода через границу с 2 загранами? У меня старый заканчивается и я планировала в Малайзию бордеран сделать уже по новому паспорту.

Так нельзя.

Чисто теоретически второй паспорт на границе в Таиланде ещё можно показать, чтоб вам туда печать выбытия поставили и с этим паспортом вы в Малайзию прибыли.