Сколько дней в году ( минимально) я должен находиться в Венгрии имея статус ВНЖ, чтобы не потерять возможность его продления?

Каждый выезд не более 90 дней.

Чтобы вам продлили, не более 90 дней за год отсутствовать. Если будет больше, до полугода, например, могут отказать продлевать с формулировкой «вам достаточно визы С».