если ты, предположим, прилетел в израиль когда Натив не работает( он же врядли круглосуточно работает) , то где подаваться на следующий день?

Натив не работает только в шабат это с вечера пт по вечер субботы. Ночью натив принимает по телефону. Если не попали в натив то идите на контроль и говорите что вы на репатриацию и натив не работает. Посмотрите заранее в каких городах принимает консул, выберите где жить будете а потом уже записывайтесь к консулу.