Подскажите как лучше поступить, починить в сервисе арендованный байк или с чистосердечным придти и показать все царапины?

Зависит от повреждений. Если только поцарапал - лучше штраф заплатить. Если какая нить деталька под замену (пластик раскрошился и т. п.) - то дешевле доехать до сервиса и самому заменить.

Была ситуация похожая, починили сами, а таец потом начал возникать, типа надо штраф заплатить иначе проблемы с полицией будут.