Приехал на Кипр по Шенгену французскому , могу находиться 3 месяца да ? Могу ли я потом выехать куда то в Европу и через пару дней вернуться на Кипр еще на 3 месяца ?

3 месяца это суммарно в течение года вроде.

Дни Шенгена на Кипре из Шенгена не вычитаются. Поэтому Вы можете 3 мес тут, 3 мес в Шенгене, потом опять 3 мес тут. Правило 90/180.