Подскажите пожалуйста, можно ли в Джакарте сделать второй загран паспорт? И забирают ли старый паспорт, если подавать на замену?

Да. Зависит от типа паспорта.

Я делала... если первый паспорт ещё действительный, то его оставляют (у меня биометрическмй был, страницы закончились)