почему билеты на самолёт Стамбул-Белград дороже чем Стамбул-Сараево. Дешевле добраться из Стамбула до Сербии через Боснию с пересадкой на автобус. С чем это может быть связано? В Боснию более строгие правила въезда может?

Если ваше время ничего не стоит, то да, дешевле, вот и ответ на вопрос.

Видимо, спрос меньше. Неделю назад ехал через Сараево - не было никаких проблем ни в аэропорту, ни на границе.

Я думаю, это связано с более высоким спросом.