Если я буду в Турции и будут иметься турецкие печати в паспорте . Меня потом израильская сторона пропустят к себе?

Максимум могут просто поинтересоваться, что вы там делали но не должно возникнуть проблем.

С Турцией никаких проблем нет у Израиля. Проблемы могут у тебя быть только из-за неправильных документов или допроса на границе. Если всё в порядке и действительно докажешь, что ты только туристить прилетел, то пропустят на то время на сколько у тебя обратный билет и бронь гостиницы.

На турецкие штампы в Израиле внимания не обращают. В Израиле штамп в паспорт не ставят - миграционный документ это бумага размером с кредитную карту, которая не наклеивается.