А если мы с женой находимся в Европе и нет возможности сходить в загс и сделать справку для репатриации , в таком случае что делать, подскажите.

Попробуйте в российском консульстве запросить в той стране, где сейчас находитесь.

Как бы это ваши проблемы а не консула но имеете право запросить эти справки через консульство рф в любой стране, только готовьтесь объяснять зачем они вам и ждать их месяца три - сами понимаете какой сейчас аншлаг; в консульстве не стоит егр - они будут делать запросы в регионы рф по вашим запросам и ждать их ответы … это не быстро и не дешево.