как надолго остаться на Филиппинах? Моя жена Филиппинка, но она особо не знает этих тонкостей.

Так если вы уже женаты официально на территории Филиппин - вам визу пора переделывать на 13А - супружескую. она дает статус резидента, живите сколько хотите.