В визовом центре можно оплачивать в рублях а не в евро?

Там берут в рублях по курсу евро.

Да, и только наличными (в Москве)

Можно, наличные за визу саму 35 евро плюс 2-3 евро за услуги банка, можно рубли, можно евро, нл сдачу отдадут в рублях если платите в евро например 50 евро.