Подскажите, на Пхи Пхи лучше добираться своим ходом или экскурсией?

Лучше самим.

В основном зависит от того насколько у вас развит навык организации самостоятельных поездок. Купить билеты на паром и забронировать гостиницу - это в принципе не сложно сделать через интернет. И не зависишь от кого-либо. Если же это сложно - то лучше экскурсию - там все сделают