А если я не буду указывать в анкете для репатриации сестру и племянницу? Страшного ничего не будет? Или сестру достаточно будет указать? Племянница вообще в другом городе.

Если отношения не очень, они не хотят репатриироваться или выкресты, вероятно, можно не указывать. На КП скажете. Здесь пишут, что иногда консул это требовал, но не особо часто. И похоже - - что это требуют скорее от евреев (галахических), чем от потомков. Если вы не еврей, но потомок (сын, внук еврея), вероятно, с этим не прицепятся. Хотя ручаться не могу, да и логика у консулов порой своеобычная. Решите на ваше усмотрение. На мой взгляд, далеко не корневой вопрос.