Подскажите, кто делал кипрскую визу, обязательно посещение посольства , или просто через турагентство и курьера.

Можно через курьера. Там неприятный момент, что они ответ курьеру дадут, но "дали или нет" не говорят - ждёшь посылку. А если ещё и отказ, то причину его они не скажут курьеру - езжай лично и забирай только лично.